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采血卡干血斑法對不穩(wěn)定樣品的保存與一般的樣品處理法方相比具有一定優(yōu)勢。大多數(shù)的干血斑樣品可以在室溫條件下保存，但是對于不穩(wěn)定的分析物，低溫可以延長保存時間。如酰基肉堿在干血斑在儲存在室溫條件超過2周會出現(xiàn)因為水解作用而不穩(wěn)定的情況，但是儲存在-18℃條件下可至少在330d內(nèi)保持穩(wěn)定。
如果不進(jìn)行分析無德穩(wěn)定性試驗（覆蓋樣品采集到分析過程），僅僅開展樣品的重復(fù)分析測定不能評價分析物的穩(wěn)定性。一般而言，分析物在DNA采血卡干血斑上的穩(wěn)定性需要考察一種或幾種儲存條件（-60℃、-15℃、2～8℃、18～22℃）。
（1）比較不同儲存周期的QC樣品（低、中、高3個濃度，一式3份）的測量值與標(biāo)示值的差異；
（2）比較真實樣品第一次測量值與經(jīng)過不同儲存周期后的測量值。前者稱為QC樣品穩(wěn)定性，后者稱為真實樣品穩(wěn)定性。QC樣品穩(wěn)定性的差異應(yīng)不超過標(biāo)示值的±15%。對于真實樣品的穩(wěn)定性，每一種儲存條件至少選擇20個樣品進(jìn)行重復(fù)分析，不選擇低于定量下限或者小于3倍定量下限濃度的樣品。重復(fù)測定的結(jié)果與兩次測定的平均值的比值應(yīng)在80%-120%，并且至少283的樣品 符合上述標(biāo)準(zhǔn)。真實樣品穩(wěn)定性的結(jié)果不僅闡明了目標(biāo)化合物（包括氨基或酯化的化合物）的穩(wěn)定性情況，還揭示了可能由水解或降解導(dǎo)致的轉(zhuǎn)化。任何明顯的濃度下降意味著目標(biāo)化合物的濃度顯著增加可能由代謝物轉(zhuǎn)化或者共軛分子水解引起。
另外，有必要將QC樣品放置在高溫條件下（30～40℃、40～50℃或50～70℃）或者凍融3次進(jìn)行穩(wěn)定性試驗，用來模擬樣品運輸過程的極端條件或者樣品儲存在低溫環(huán)境的情況下。上述 QC樣品的測定要隨行標(biāo)準(zhǔn)曲線和普通QC樣品，一至三份，并且偏差應(yīng)在標(biāo)示值和普通的±15%，這樣才能說明干血斑樣品在高溫或者凍融條件下使穩(wěn)定的。
有些化合物易發(fā)生酶降解，這種過程可能發(fā)生在干燥階段或者在點樣之前，但酶抑制劑又不方便在點樣前添加，因此必須對沒有經(jīng)過任何處理的分析物在全血中2～3h的穩(wěn)定性進(jìn)行考察，已覆蓋血樣采集和干燥過程。如果試驗結(jié)果顯示樣品不穩(wěn)定，那么該化合物不適合干血斑點樣。
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