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新生兒采血卡

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新生兒采血卡全基因組分析

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新生兒采血卡全基因組分析

發(fā)布日期:2019-03-06 作者: 點(diǎn)擊:

                          新生兒采血卡全基因組分析

 

新生兒血液是從腳跟棒中提取的并儲(chǔ)存在新生兒采血的濾紙,50年來(lái)一直是篩查出生缺陷的標(biāo)準(zhǔn)。這種干血樣主要用于小分子的分析.最近,這種干血卡的DNA補(bǔ)體已被用于有針對(duì)性的基因檢測(cè),例如囊性纖維化中的單核苷酸多態(tài)性。擴(kuò)大這樣的測(cè)試,以包括更多的特性,也許包括整個(gè)基因組掃描,已經(jīng)被討論為一種形式上的可能性。然而,到目前為止,由于DNA回收技術(shù)效率低下,從這些干血卡中獲得的DNA數(shù)量一直是有限的。

一種新的技術(shù)被用于從標(biāo)準(zhǔn)新生兒采血卡中高效釋放DNA。使用標(biāo)準(zhǔn)卡,平均儲(chǔ)存10年后收集,約1/40。對(duì)干燥的新生兒采血卡血液標(biāo)本(2份,3mm)進(jìn)行處理,獲得質(zhì)量足以直接用于全基因組掃描的DNA。使用同樣的dna釋放技術(shù),也顯示出大約1/250TH在原純化的DNA(1ng)可以進(jìn)行全基因組擴(kuò)增,從而產(chǎn)生額外的擴(kuò)增產(chǎn)物。然后將擴(kuò)增出的DNA產(chǎn)物用于分析,獲得99%99%以上的統(tǒng)計(jì)結(jié)果。

這些數(shù)據(jù)表明,從不到10%的標(biāo)準(zhǔn)新生兒采血卡血液樣本中提取的dna,在一張采血卡片上保存了幾年,可以支持一個(gè)全基因組的新生兒基因測(cè)試計(jì)劃。

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